此時，病情非但沒有好轉，反而出現(xiàn)惡化或加重，肝功能反復異常，癥狀突出。異型慢性乙型肝炎患者血清乙肝病毒e抗原雖為陰性，但是肝組織內乙肝病毒脫氧核糖核酸呈進行性復制，肝臟有嚴重而迅速進展的慢性活動性炎癥，血清轉氨酶水平忽高忽低，波動性很大，容易發(fā)展為重型肝炎、肝硬化或肝癌，干擾素治療效果不佳。
據(jù)不完全統(tǒng)計，我國現(xiàn)有乙型肝炎患者中1/3以上的病例屬于異型慢性乙型肝炎，現(xiàn)有的肝硬化病例，乙型肝炎“小三陽”患者遠遠多于“大三陽”患者，提示我國異型慢性乙型肝炎占據(jù)十分重要的位置，絕不可小視。
異型慢性乙型肝炎的識別方法：乙型肝炎患者檢查乙肝病毒指標發(fā)現(xiàn)為“小三陽”或“小二陽”，切不可誤認為一定是病情好轉，還需進一步檢查肝功能系列和乙肝病毒脫氧核糖核酸。如果肝功能指標異常（轉氨酶、膽紅素反復升高）、乙肝病毒脫氧核糖核酸為陽性，就應該診斷為異型慢性乙型肝炎。對于異型慢性乙型肝炎的治療主張綜合治療、聯(lián)合用藥，一般不主張使用干擾素治療，因為干擾素對于乙肝病毒變異引起的異型病毒療效比較差。
