乙型肝炎病毒基因組為一半環(huán)狀雙股脫氧核糖核酸,全長約4761個堿基對(bp),其負股(長鏈)有4個主要開放讀碼框架(ORF):S基因區(qū)、C基因區(qū)、P基因區(qū)和X基因區(qū)。
1.S基因區(qū)全長1167個堿基對,由S基因、前S1基因及前S2基因組成。S基因區(qū)編碼產(chǎn)物均屬于乙型肝炎病毒囊膜蛋白,即乙型肝炎表面抗原(HBsAg)的范疇。
2.C基因區(qū)全長636個堿基對,由前C基因和C基因組成。前C基因(87個堿基對)編碼含29個氨基酸的多肽,稱功能性信號肽;C基因(549個堿基對)編碼乙型肝炎核心抗原(HBcAg);前C基因和C基因連續(xù)編碼,則產(chǎn)生乙型肝炎e抗原前體蛋白。功能性信號肽將乙型肝炎e抗原前體蛋白引導至肝細胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜,其氨基端和羧基端被部分削減,即形成乙型肝炎e抗原。
3.P基因區(qū)全長2496個堿基對,編碼含832個氨基酸的多肽,稱為乙型肝炎病毒脫氧核糖核酸多聚酶(聚合酶)。此酶為乙型肝炎病毒脫氧核糖核酸生物合成所必需。血清乙型肝炎病毒脫氧核糖核酸多聚酶陽性是乙型肝炎病毒復(fù)制活躍和傳染性強的標志。
4.X基因區(qū)全長462個堿基對,編碼154個氨基酸的多肽,即乙型肝炎x抗原。乙型肝炎x抗原也是乙型肝炎病毒復(fù)制活躍和傳染性強的標志。血清乙型肝炎x抗原及其抗體(抗HBx)動態(tài)變化和乙型肝炎e抗原及其抗體大體一致。乙型肝炎x抗原有反式激活(transactivation)功能,可激活肝細胞基因組內(nèi)的原癌基因,促使肝細胞癌變,故與原發(fā)性肝癌的發(fā)生有關(guān)。血清乙型肝炎x抗體陽性提示乙型肝炎病毒復(fù)制減弱,但乙型肝炎e抗原陽性的慢性活動性肝炎、肝硬化和原發(fā)性肝癌患者血清中也常檢出乙型肝炎x抗體。