檢測方法不精確
實際已產(chǎn)生抗體，但因檢測方法不精確而致結(jié)果陰性。這時應(yīng)當(dāng)用最靈敏的方法，如酶聯(lián)免疫法或放射免疫法來重新檢測，因為有的地方檢測方法不先進或不靈敏而得出假陰性結(jié)果。
免疫反應(yīng)太弱
機體對疫苗的免疫反應(yīng)太弱，只產(chǎn)生微量的抗體，以至用先進的檢測方法仍未能發(fā)現(xiàn)表面抗體的蹤跡。這時可加大乙肝疫苗的劑量（每次10微克），每月注射1次，共3次。同時，注射乙肝疫苗合用其他免疫刺激藥物，如豬苓多糖、卡介苗等，被認為可以提高免疫效果。
已發(fā)生隱匿性感染
如按規(guī)定時間接種后仍不產(chǎn)生表面抗體，則可應(yīng)用PCR（體外核酸擴增技術(shù)）方法檢測被接種者血清中的乙肝病毒核酸（HBV－DNA）。因為，有少數(shù)病人實際上已感染了乙肝病毒，但其乙肝表面抗原（HBsAg）的產(chǎn)量很少，用現(xiàn)有的檢測方法查不出來，或者乙肝病毒已經(jīng)發(fā)生變異，與普通試劑不發(fā)生反應(yīng)，另外還可能有其他原因。這些病人雖然已感染了乙肝病毒，但不產(chǎn)生免疫反應(yīng)而機體呈免疫耐受狀態(tài)，在這種情況下，再注射乙肝疫苗，也不會產(chǎn)生表面抗體?；蚩蓹z測其他肝病毒標(biāo)志物，如核心抗體（抗HBc）、e抗體、e抗原等是否為陽性。如果為陽性則說明感染了病毒，在這種情況下，再注射乙肝疫苗也可能不會產(chǎn)生抗－HBs。
有乙肝家族史或經(jīng)常和乙肝患者接觸的人，應(yīng)特別注意乙肝疫苗的接種效果。乙肝家庭成員感染乙肝病毒的幾率極高，有一些成員感染乙肝病毒后，表現(xiàn)出隱匿狀態(tài)。乙肝患者所生的子女，在出生后一定要及時注射乙肝疫苗，這樣可以阻斷大部分乙肝病毒的傳播。但是，即便是及時注射乙肝疫苗，仍會有極少數(shù)新生兒免疫接種失敗，這可能與母體孕期宮內(nèi)感染乙肝病毒和遺傳因素有關(guān)。對此家長不必大驚小怪，也不要亂用藥；定期復(fù)查，注意肝功能變化至關(guān)重要。
免疫功能低下者
有類似情況的人不易產(chǎn)生抗體，如晚期腎病、器官移植后、艾滋病感染者等。
乙肝病毒容易發(fā)生變異，變異后的病毒，其生物特性有了新的變化，可使乙肝疫苗無法發(fā)揮作用。另外，一些乙肝病毒感染者，乙肝病毒表面抗原的亞型有所不同。亞型種類有多種，乙肝疫苗是針對主要的病毒亞型而設(shè)，所以難免有顧及不到的亞型，如果是較為罕見的病毒亞型，乙肝疫苗也不會有保護作用。
總之，打了乙肝疫苗不產(chǎn)生抗體者，可以加打一個療程；如果還不產(chǎn)生抗體，應(yīng)注意排除是否為隱匿性或低水平乙肝病毒感染者，以及是否存在乙肝病毒變異情況，以后的復(fù)查工作須在水平較高的正規(guī)醫(yī)院進行。
