乙肝病毒基因變異可見(jiàn)于乙肝病毒基因序列的任何部位，但多發(fā)生在具有重要功能的區(qū)段內(nèi)，可影響乙肝病毒的復(fù)制、表達(dá)、致病性及治療。
乙肝病毒基因組系雙股環(huán)狀DNA，其核苷酸長(zhǎng)度為3．2kb，它包括兩個(gè)鏈：一個(gè)長(zhǎng)度固定的負(fù)鏈和另一長(zhǎng)度不定的正鏈。負(fù)鏈能編碼全部已知的HBV蛋白質(zhì)，而其正鏈開(kāi)放讀碼區(qū)，不能編碼病毒蛋白。負(fù)鏈共有4個(gè)開(kāi)放讀碼框架（ORF），分別稱(chēng)作S區(qū)、C區(qū)、X區(qū)和P區(qū)，分別編碼外膜蛋白、核心蛋白、X抗原和DNA多聚酶。它們都可以發(fā)生變異，但發(fā)生的頻率、類(lèi)型和意義不同。歸納起來(lái)有點(diǎn)突變（替換）、缺失、插入、重復(fù)、重組、重排等形式，其中以點(diǎn)突變最常見(jiàn)，其次為缺失和插入變異。
