由于肝穿刺活組織學檢查是一種創(chuàng)傷性診斷措施。患者難以接受，普及相對比較困難。而且B超和CT等非創(chuàng)傷性檢查已基本能夠做出脂肪肝的診斷。故目前肝穿刺主要用于：①局灶性脂肪肝與腫瘤區(qū)別：②探明某些少見疾病，如血色病、膽固醇酯儲積癥、糖原儲積癥等；③無癥狀性可疑非酒精性肝炎，肝穿刺活檢是惟一診斷手段；④戒酒后酒精性肝病或酒精性肝病有不能解釋的臨床或生化異常表現(xiàn)者；⑤肥胖者減少原有體重10％后，肝酶學異常仍持續(xù)者，須肝穿刺活檢尋找其他原因；⑥任何懷疑不是單純肝細胞脂變或懷疑多病因引起者；⑦懷疑重型肝炎系脂肪肝所致，須肝活檢明確診斷并了解病因者；⑧評估某些血清學及影像學檢查診斷脂肪肝、纖維化的可靠性，需以肝活組織學改變?yōu)闃藴?，并用以客觀評價某一治療方案對脂肪肝纖維化治療的確切效果。
單純性非酒精性脂肪肝的病理診斷標準為：病變主體在肝小葉，低倍鏡下1/3以下的肝細胞脂肪變性，但有其他明顯組織學改變。單純性脂肪肝的分級標準為：低倍鏡下脂肪變性累及1/3～1/2小葉肝細胞者為輕度：脂肪變性累及1/2～2/3小葉肝細胞者為中度；脂肪變性累及2/3以下小葉肝細胞者為重度，嚴重者所見肝臟像一片脂肪組織，呈“漁網(wǎng)”狀。肝小葉內(nèi)小于1/3的肝細胞有脂肪變稱為肝細胞脂肪變性。
非酒精性脂肪性肝炎的病理診斷標準為：大泡性脂肪變，伴肝細胞氣球樣變，以及小葉內(nèi)混合性炎癥細胞浸潤?？砂橛懈卫w維化、糖原核、小葉內(nèi)脂肪性肉芽腫、嗜酸小體、脂肪囊腫以及門管區(qū)炎癥。但這些病變并非診斷非酒精性脂肪性肝炎的必備條件。
根據(jù)肝細胞脂肪變性、氣球樣變和小葉內(nèi)炎癥的程度可將非酒精性脂肪性肝炎分為輕度、中度和重度三級，而根據(jù)伴隨肝纖維化的程度可將其分為1～4期。1期為肝腺泡3區(qū)竇周纖維化；2期為上述病變和門靜脈周圍纖維化；3期為2期病變和橋接纖維化；4期為脂肪性肝硬化。在肝硬化發(fā)生后，肝細胞脂肪變性和炎癥有時可完全消退。
