慢性乙型肝炎難治，主要原因有以下5個方面。
?。?）病毒多處存在：乙型肝炎病毒為泛嗜性病毒，可在肝臟、膽管上皮細胞、胰腺、淋巴等組織和細胞中存在和復(fù)制?？共《舅幬镙^易清除血中乙型肝炎病毒，而組織細胞中的乙型肝炎病毒不易被清除或清除較晚，成為復(fù)發(fā)的重要原因。
?。?）免疫耐受：母嬰垂直傳播與嬰幼兒水平傳播為我國乙型肝炎病毒主要感染特點。機體免疫系統(tǒng)發(fā)育階段與乙型肝炎病毒感染相伴隨，成熟后誤將乙型肝炎病毒認為是自身成分而難以發(fā)揮排斥清除反應(yīng)。
?。?）基因整合：早期感染乙型肝炎病毒，由于免疫耐受常無感染表現(xiàn)，至成年期發(fā)現(xiàn)而開始治療時，中間往往間隔10余年，乙型肝炎病毒脫氧核糖核酸早已發(fā)生多處基因整合。此時治療即使血清中乙型肝炎病毒多項指標（如“兩對半”檢查）下降或消失，但細胞內(nèi)整合的病毒基因又可在停藥后復(fù)制、表達，造成反跳或復(fù)發(fā)。
?。?）基因變異：傳統(tǒng)認為乙型肝炎病毒指標“大三陽”轉(zhuǎn)為“小三陽”是病毒復(fù)制減弱、傳染性降低、病情好轉(zhuǎn)的標志。最新研究表明不少乙型肝炎病毒指標“小三陽”病人，其乙型肝炎病毒脫氧核糖核酸呈陽性。這些病人95％以上存在前C區(qū)基因突變。這種突變株感染特點為：①乙型肝炎病毒表面抗原和乙型肝炎病毒e抗體陽性，但乙型肝炎病毒e抗原陰性；②乙型肝炎病毒脫氧核糖核酸陽性，病毒仍活躍復(fù)制，仍有傳染性；③由于乙型肝炎病毒e抗原不能表達，病毒不易被清除，易致慢性化發(fā)展；④乙型肝炎病毒e抗原前體在肝細胞內(nèi)的過量蓄積還易招致免疫（CTL）攻擊，易致肝炎向重癥化演變；⑤這種變異株對干擾素治療不敏感，表現(xiàn)為復(fù)發(fā)率高，遠期療效不佳。
（5）目前抗病毒藥物不能破壞乙型肝炎病毒共價環(huán)狀脫氧核糖核酸（cccD-NA）：cccDNA在慢性乙型肝炎持續(xù)感染過程中起著重要作用。目前各種抗病毒藥物，尚不能對其有效地打擊和消滅，只能對乙型肝炎病毒的其他部位或環(huán)節(jié)進行抑制，用藥期間，療效尚可，一旦停藥，乙型肝炎病毒的復(fù)制又死灰復(fù)燃。另外，還有不少的主觀因素在很大程度上影響了療效，如：①治療對象選擇不合適。許多病人不屬于干擾素抗病毒治療的范圍（如慢性病毒攜帶者、中晚期的肝硬化病人等），都硬性使用干擾素治療，非但難以取得療效，反而容易造成不良反應(yīng)。②用藥方案不正確。一些病人雖然屬于抗病毒治療的范圍，但是所選用的抗病毒治療藥物及其劑量、療程卻不正確，臨床上也難以奏效。例如，我國乙型肝炎病人對于α類干擾素的合適劑量應(yīng)為500萬～1000萬單位，療程為6個月～1年，但是卻很少有病人照此進行，有的病人只使用100萬單位的干擾素；有的使用1～2個月，由于種種原因，便停止了用藥，治療也就前功盡棄。③濫用或亂用藥物，有的病人四處求醫(yī)，今天用西藥，明天用中藥；名目繁多的虛假肝病廣告更讓廣大病人無所適從。濫用藥物的結(jié)果只能使肝病雪上加霜，后果更慘。
